Ontologies
WHEAT_TAX
Wheat Taxa Gold Standard (WHEAT_TAX)
OWL
View license
Last submission date September 6, 2018
Summary
Classes
Properties
Instances
Notes
Mappings
Widgets
SPARQL

General information

Manually built by Catherine Roussey, inspired by https://fr.wikipedia.org/wiki/Taxonomiedublé. Each species proposed into the wheat species table have been validated with European Wheat data base http://genbank.vurv.cz/ewdb/. The taxon name and its ranking was firstly validated with the use of taxref reference table from INPN. NCBI's taxonomy have been used when not found in taxref. Then links to agrovoc's thesaurus, NAL and CABI Have been added. Links to ITIS database have been added, and also the links to DBpedia. Be warned : DBpedia contains two missing species :triticum zhukovsyi and triticum compactum erinaceum which are not in taxref. triticum zhukovsyi is in European Wheat data base. Links to TAXREF-LD have also been added. See more...
Initial created on March 8, 2018. For additional information, contact Catherine Roussey (catherine.roussey@inrae.fr).

Languages

Keywords and classes

taxonomy
Triticum

Categories and subjects

Agro
C 7950
Svg Vector Icons : http://www.onlinewebfonts.com/icon
Export all metadata

Metrics

FAIR score
Beta

Total score : 277.0 ( 57.0%)
See details

Submissions

Identifiers

URI

urn:absolute:ontology.irstea.fr/agronomicTaxon/ressource/goldStandard

Version IRI

http://ontology.irstea.fr/agronomictaxon/core/20171115/1
http://ontology.irstea.fr/agronomictaxon/core/20171115/1

Other identifier

https://doi.org/10.1007/978-3-319-13674-5_29
https://doi.org/10.1007/978-3-319-13674-5_29

AgroPortal URI

https://agroportal.lirmm.fr/ontologies/WHEAT_TAX
https://agroportal.lirmm.fr/ontologies/WHEAT_TAX

Dates

Creation date

March 8, 2018

Submission date

September 6, 2018

Modification date

September 6, 2018

Persons and organizations

Contact

Catherine Roussey

Creator

Catherine Roussey

Publisher

TSCF

Other links

Projects and usage information

Methodology and provenance

Created with

http://protege.stanford.edu
http://protege.stanford.edu

Community

Notes

construit manuellement par Catherine Roussey à partir du document https://fr.wikipedia.org/wiki/Taxonomie_du_bl%C3%A9. Chaque espèce de blé proposé dans le tableau des espèces de blé a été validé à l'aide de European Wheat data base http://genbank.vurv.cz/ewdb/. Le nom du taxon et son rang a été validé en regardant d'abord le référentiel taxref de l'INPN dans un premier temps. S'il n'existait pas dans taxref alors la taxonomie du NCBI a été étudié. Les liens vers les thesaurus agrovoc, NAL et CABI ont ensuite été ajoutés. Les liens vers la base de données ITIS ont été ajoutés. Les liens vers DBpedia ont été ajoutés. Attention DBpedia propose deux espèces qui ont disparues triticum zhukovsyi et triticum compactum erinaceum. Elles ne sont pas dans taxref. triticum zhukovsyi apparait dans European Wheat data base. Les liens vers TAXREF-LD ont été ajouté.

Groups

National research institute for agriculture, food and the environment

Content

Identifier pattern

http://ontology.irstea.fr/agronomicTaxon/ressource/goldStandard#.+
http://ontology.irstea.fr/agronomicTaxon/ressource/goldStandard#.+

Preferred namespace URI

http://ontology.irstea.fr/agronomicTaxon/resource/goldStandard
http://ontology.irstea.fr/agronomicTaxon/resource/goldStandard

Preferred namespace prefix

wheattax

Example of resource

http://ontology.irstea.fr/agronomictaxon/core#FamilyRank
http://ontology.irstea.fr/agronomictaxon/core#FamilyRank

Visits

Views of WHEAT_TAX

No views available for WHEAT_TAX.