URI*
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http://ontology.irstea.fr/agronomictaxon/core#
http://ontology.irstea.fr/agronomictaxon/core#
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Contact*
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Catherine Roussey (catherine.roussey@irstea.fr)
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Submission date
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September 6, 2018
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Deprecated
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false
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Description*
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Manually built by Catherine Roussey, inspired by https://fr.wikipedia.org/wiki/Taxonomiedublé. Each species proposed into the wheat species table have been validated with European Wheat data base http://genbank.vurv.cz/ewdb/. The taxon name and its ranking was firstly validated with the use of taxref reference table from INPN. NCBI's taxonomy have been used when not found in taxref. Then links to agrovoc's thesaurus, NAL and CABI Have been added. Links to ITIS database have been added, and also the links to DBpedia. Be warned : DBpedia contains two missing species :triticum zhukovsyi and triticum compactum erinaceum which are not in taxref. triticum zhukovsyi is in European Wheat data base. Links to TAXREF-LD have also been added.
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Documentation
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http://ontology.irstea.fr/pmwiki.php/Site/AgronomicTaxon
http://ontology.irstea.fr/pmwiki.php/Site/AgronomicTaxon
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Example of resource
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http://ontology.irstea.fr/agronomictaxon/core#FamilyRank
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Creator
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Catherine Roussey |
Subject
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http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_7631, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_7950
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Formality level
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http://w3id.org/nkos/nkostype#ontology
http://w3id.org/nkos/nkostype#ontology
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License
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Representation language*
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OWL
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Syntax
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http://www.w3.org/ns/formats/RDF_XML
http://www.w3.org/ns/formats/RDF_XML
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Homepage
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http://ontology.irstea.fr/pmwiki.php/Site/AgronomicTaxon
http://ontology.irstea.fr/pmwiki.php/Site/AgronomicTaxon
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Other identifier
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https://doi.org/10.1007/978-3-319-13674-5_29
https://doi.org/10.1007/978-3-319-13674-5_29
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Indexed or included in catalog or repository
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https://agroportal.lirmm.fr/
agroportal.lirmm.fr
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Generic type
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http://omv.ontoware.org/2005/05/ontology#ApplicationOntology
http://omv.ontoware.org/2005/05/ontology#ApplicationOntology
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Keywords
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taxonomy, Triticum
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Modification date
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September 6, 2018
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Natural language
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Notes
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construit manuellement par Catherine Roussey à partir du document https://fr.wikipedia.org/wiki/Taxonomie_du_bl%C3%A9.
Chaque espèce de blé proposé dans le tableau des espèces de blé a été validé à l'aide de European Wheat data base http://genbank.vurv.cz/ewdb/. Le nom du taxon et son rang a été validé en regardant d'abord le référentiel taxref de l'INPN dans un premier temps. S'il n'existait pas dans taxref alors la taxonomie du NCBI a été étudié.
Les liens vers les thesaurus agrovoc, NAL et CABI ont ensuite été ajoutés.
Les liens vers la base de données ITIS ont été ajoutés.
Les liens vers DBpedia ont été ajoutés. Attention DBpedia propose deux espèces qui ont disparues triticum zhukovsyi et triticum compactum erinaceum. Elles ne sont pas dans taxref. triticum zhukovsyi apparait dans European Wheat data base.
Les liens vers TAXREF-LD ont été ajouté.
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Preferred namespace prefix
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wheattax
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Preferred namespace URI
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http://ontology.irstea.fr/agronomicTaxon/resource/goldStandard
http://ontology.irstea.fr/agronomicTaxon/resource/goldStandard
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Publisher
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TSCF |
Creation date*
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March 8, 2018
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Status*
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alpha
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URI Lookup Endpoint
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http://agroportal.lirmm.fr/search?ontologies=WHEAT_TAX&require_exact_match=true&q=
search?ontologies=WHEAT_TAX&require_exact_match=true&q=
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Identifier pattern
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http://ontology.irstea.fr/agronomicTaxon/ressource/goldStandard#.+
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Created with
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http://protege.stanford.edu
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Version IRI
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http://ontology.irstea.fr/agronomictaxon/core/20171115/1
http://ontology.irstea.fr/agronomictaxon/core/20171115/1
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